簡(jiǎn)要描述:PikoGreen dsDNA quantitation reagent(優(yōu)于PicoGreen)是一種極為靈敏的雙鏈DNA熒光染料,于雙鏈DNA的定量。測(cè)定DNA濃度在cDNA文庫(kù)構(gòu)建、DNA亞克隆、PCR產(chǎn)物估測(cè)等領(lǐng)域中非常重要,另外疫苗等生物制品中殘留微量DNA的檢測(cè)因關(guān)系人身健康,顯得尤為重要。
產(chǎn)品分類
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品牌 | 其他品牌 | 貨號(hào) | AN54L029 |
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規(guī)格 | 1ML | 供貨周期 | 現(xiàn)貨 |
主要用途 | 在存在ssDNA、RNA和單體核苷酸的條件下,可以選擇性地檢測(cè)低至25 pg/m | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè) |
PikoGreen dsDNA quantitation reagent是一種極為靈敏的雙鏈DNA熒光染料,僅與DNA雙鏈結(jié)合后才發(fā)出熒光,且所產(chǎn)生的熒光與DNA濃度呈正比,在存在ssDNA、RNA和單體核苷酸的條件下,可以選擇性地檢測(cè)低至25 pg/mL的dsDNA。與傳統(tǒng)DNA定量方法相比,具有靈敏度高,特異性強(qiáng),耐受性好,線性范圍寬及方便操作等優(yōu)點(diǎn),適用于cDNA文庫(kù)構(gòu)建、DNA亞克隆、PCR產(chǎn)物等領(lǐng)域的DNA濃度的精確測(cè)定。相比傳統(tǒng)的方法,Pikogreen dsDNA Quantitation Reagent定量具有以下優(yōu)勢(shì):
靈敏:數(shù)量級(jí)較UV吸光讀數(shù)更敏感,可節(jié)省樣品。
特異性強(qiáng):只結(jié)合dsDNA,特異性強(qiáng),不受樣品常規(guī)污染影響。傳統(tǒng)紫外吸光法容易受樣品中存在的單鏈DNA,蛋白,RNA等影響。
耐受性好:耐受較高濃度的鹽、尿素、乙醇、氯仿、去垢劑、蛋白或瓊脂糖,可以直接定量PCR擴(kuò)增產(chǎn)物而無需從反應(yīng)混合物中純化DNA。
線性范圍寬:PikoGreen dsDNA染料測(cè)定DNA濃度,在100pg/ml-100ng/ml范圍內(nèi)呈良好線性;熒光計(jì)兼容。
容易使用:在樣品中加入染料,等待5~6 min染色,然后讀數(shù)即可,且適用于96和384孔板。與大多數(shù)基于熒光的酶標(biāo)儀和可適用于各種DNA樣品分析、PCR的分析、芯片樣品、DNA損傷分析、酶活性分析、基因組DNA定量以及復(fù)雜混合物中dsDNA的檢測(cè)和病毒DNA定量等多種領(lǐng)域。
該分析在四個(gè)數(shù)量級(jí)范圍內(nèi)呈線性,且?guī)缀鯚o序列依賴性,可以精確地測(cè)量多個(gè)來源的DNA,包括基因組DNA、病毒DNA、小量提取DNA或PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。該方法因其穩(wěn)定性、靈敏性,已經(jīng)錄入《中國(guó)藥典》。
訂購(gòu)信息
產(chǎn)品名稱 | 貨號(hào) | 規(guī)格 |
PikoGreen dsDNA quantitation reagent(優(yōu)于PicoGreen) | AN54L029 | 1 mL |
運(yùn)輸與保存
藍(lán)冰運(yùn)輸。-20℃避光保存,有效期24個(gè)月。
使用方法
1. PikoGreen工作液的配制
使用前將PikoGreen dsDNA定量試劑回溫至室溫;PikoGreen以100 µL 200×的濃縮液形式保存于無水DMSO中的(共10管)。實(shí)驗(yàn)當(dāng)天,根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求用1×TE按1:200 的比例稀釋適量定量試劑濃縮液。例如要準(zhǔn)備足夠的操作溶液以2 mL檢測(cè)體系測(cè)定20個(gè)樣品,可向19.9 mL 1×TE 中加入100 µL PikoGreen dsDNA 定量試劑。工作液見光易降解,盡量在配好后幾小時(shí)內(nèi)使用。
2. 配制標(biāo)準(zhǔn)品DNA溶液
(1)用1 X TE溶液溶解dsDNA制備1 μg/mL dsDNA 。根據(jù)在1 cm 光程長(zhǎng)度的比色杯中A260 nm時(shí)的吸光度確定DNA 濃度;相應(yīng)于1 μg/mLdsDNA 溶液A260=0.02。標(biāo)準(zhǔn)液常用小牛胸腺DNA制備,PikoGreen 試劑測(cè)定法在通常污染核酸*劑的幾種復(fù)合物存在的條件下仍能保持線性良好,但是,為了得到有效的對(duì)照處理,被用來做標(biāo)準(zhǔn)曲線的dsDNA 溶液要用和實(shí)驗(yàn)樣品相同的方式來處理,并且應(yīng)該包含相同的可能存在的污染物。
(2)制備從0.5 ng/mL 到500ng/mL(見表1)單重復(fù)8 個(gè)點(diǎn)的標(biāo)準(zhǔn)曲線。配制一系列的標(biāo)準(zhǔn)DNA 溶液,然后與等體積的PikoGreen 工作液混和,放入1 x 1cm 比色杯中?;旌舷嗤w積的1 x TE 和PikoGreen 操作溶液作為空白對(duì)照,避光于室溫下放置2~5 min。
表1: 用1 x 1cm 比色杯時(shí)DNA 標(biāo)準(zhǔn)濃度配制參考
標(biāo)準(zhǔn)DNA 溶液濃度(ng/mL) | 標(biāo)準(zhǔn)DNA 溶液體積(mL) | PikoGreen 工作液體積(mL) | 標(biāo)準(zhǔn)DNA 終濃度(ng/mL) |
1000 | 1 | 1 | 500 |
200 | 1 | 1 | 100 |
50 | 1 | 1 | 25 |
20 | 1 | 1 | 10 |
5 | 1 | 1 | 2.5 |
2 | 1 | 1 | 1 |
1 | 1 | 1 | 0.5 |
0 | 1 | 1 | 空白 |
(3) 當(dāng)用微量檢測(cè)皿適配器時(shí),PikoGreen 測(cè)定也可在較低的測(cè)定體積(50 μL 到200 μL)內(nèi)完成。產(chǎn)生從1 ng/mL 到100 ng/mL(見表2)的標(biāo)準(zhǔn)曲線,配制一系列的標(biāo)準(zhǔn)DNA 溶液,然后與等體積的PikoGreen 工作液混和,將至少50 μL 溶液轉(zhuǎn)移到微量檢測(cè)皿中。確信不要在樣品中引入氣泡,輕輕地彈微量檢測(cè)皿的外部經(jīng)??梢则?qū)散氣泡。避光于室溫下放置2-5 min。
表2:用微量檢測(cè)皿DNA 標(biāo)準(zhǔn)濃配制參考
標(biāo)準(zhǔn)DNA 溶液濃度(ng/mL) | 標(biāo)準(zhǔn)DNA 溶液體積(mL) | PikoGreen 工作液體積(mL) | 標(biāo)準(zhǔn)DNA 終濃度(ng/mL) |
200 | 30 | 30 | 100 |
50 | 30 | 30 | 25 |
20 | 30 | 30 | 10 |
5 | 30 | 30 | 2.5 |
2 | 30 | 30 | 1 |
0 | 30 | 30 | 空白 |
(4) 孵育后用合適的熒光計(jì)測(cè)量樣品熒光值。Ex/Em=480 nm/520 nm,為了減少光漂白,應(yīng)保持所有樣品的檢測(cè)時(shí)間一致。用熒光值最大的樣品校正儀器。
(5)用檢測(cè)數(shù)據(jù)與DNA標(biāo)準(zhǔn)溶液濃度做回歸分析,制作標(biāo)準(zhǔn)曲線。
3. 樣品分析
(1)用1 x TE 稀釋待測(cè)DNA 樣品至需要的體積(1x1 cm 比色杯需1.0 mL,微量檢測(cè)皿需25~100 μL)。對(duì)樣品高度稀釋可以確保任何污染物都被最大限度地沖淡。然而,也要避免取樣體積太小而無法精確吸取的情況。
(2)在每個(gè)樣品中加入等體積PikoGreen 工作液,混合好,將混合物移入合適的比色杯,避光于室溫下放置2~5 min。
(3)檢測(cè)、讀取熒光值,換算樣品中dsDNA濃度??梢詫?duì)樣品進(jìn)行不同的稀釋處理重復(fù)測(cè)定以確保結(jié)果的準(zhǔn)確性。
注意事項(xiàng)
本產(chǎn)品僅限于科學(xué)實(shí)驗(yàn)研究使用,不得用于臨床診斷、治療等領(lǐng)域。
PikoGreen定量試劑含有DMSO,PikoGreen 是結(jié)合dsDNA,操作時(shí)采取適當(dāng)防護(hù),戴手套小心操作。
盡管常見污染物不會(huì)影響PikoGreen 檢測(cè)dsDNA濃度(見表3),但是當(dāng)樣品中dsDNA濃度太低,RNA, ssDNA濃度超過dsDNA 10倍以上時(shí),RNA, ssDNA等污染還是會(huì)對(duì)檢測(cè)結(jié)果產(chǎn)生較大干擾,在此種情況下,RNA 酶可以消除RNA干擾, RNA 酶A、酶T1 、核酸酶S1 結(jié)合能除去ssDNA干擾,從而保證樣品熒光值是由dsDNA 產(chǎn)生。
表3:Pikogreen定量耐受的污染物列表
物質(zhì)名稱 | 最大耐受濃度 | 信號(hào)變化百分比 |
Salts | ||
Ammonium acetate | 50 mM | 3% decrease |
Sodium acetate | 30 mM | 3% increase |
Sodium chloride | 200 mM | 30% decrease |
Zinc chloride | 5 mM | 8% decrease |
Magnesium chloride | 50 mM | 33% decrease |
Urea | 2 M | 9% increase |
Organic Solvents | ||
Phenol | 0.1% | 13% increase |
Ethanol | 10% | 12% increase |
Chloroform | 2% | 14% increase |
Detergents | ||
Sodium dodecyl sulfate | 0.01% | 1% decrease |
Triton X-100 | 0.1% | 7% increase |
Proteins | ||
Bovine serum albumin | 2% | 16% decrease |
IgG | 0.1% | 19% increase |
Other Compounds | ||
Polyethylene glycol | 2% | 8% increase |
Agarose | 0.1% | 4% increase |
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